MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Marinitoga piezophila KA3 chromosome

Total Repeats: 5932

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016751	CAA	2	6	8	13	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_016751	T	6	6	25	30	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_016751	TA	3	6	60	65	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_016751	TAT	2	6	79	84	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_016751	T	6	6	90	95	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_016751	T	6	6	1506	1511	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_016751	TA	4	8	2034	2041	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_016751	ACAA	2	8	2066	2073	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
9	NC_016751	T	6	6	2075	2080	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_016751	TAA	2	6	2087	2092	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_016751	ATATA	2	10	2097	2106	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_016751	AAC	2	6	2110	2115	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_016751	AGGG	2	8	2129	2136	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
14	NC_016751	AGC	2	6	2883	2888	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_016751	TCC	2	6	5593	5598	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
16	NC_016751	TATTT	2	10	5605	5614	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_016751	ATT	2	6	5616	5621	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_016751	TA	3	6	5637	5642	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_016751	AT	3	6	5680	5685	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_016751	AT	4	8	5692	5699	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_016751	TTA	2	6	6600	6605	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_016751	ATG	2	6	6607	6612	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23	NC_016751	G	7	7	6612	6618	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
24	NC_016751	AT	3	6	6975	6980	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_016751	GGA	2	6	7473	7478	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
26	NC_016751	TAA	2	6	11291	11296	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_016751	CTT	2	6	11309	11314	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_016751	T	6	6	11325	11330	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_016751	AAT	2	6	11333	11338	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_016751	GTT	2	6	11342	11347	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
31	NC_016751	TAA	2	6	11368	11373	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_016751	AGG	2	6	11401	11406	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
33	NC_016751	A	8	8	12660	12667	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_016751	CCT	2	6	13691	13696	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
35	NC_016751	AT	3	6	14068	14073	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_016751	TAA	2	6	14081	14086	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_016751	AAAAAT	2	12	14106	14117	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_016751	A	6	6	14118	14123	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_016751	AGGA	2	8	14126	14133	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
40	NC_016751	ATA	2	6	14150	14155	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_016751	ATT	2	6	14162	14167	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_016751	A	7	7	14178	14184	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_016751	AATA	2	8	14203	14210	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_016751	ATA	2	6	14214	14219	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_016751	A	6	6	14226	14231	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_016751	A	6	6	14250	14255	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_016751	TA	4	8	14269	14276	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_016751	AGG	2	6	14301	14306	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
49	NC_016751	AGG	2	6	14563	14568	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
50	NC_016751	ATT	2	6	15611	15616	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_016751	GGT	2	6	16862	16867	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
52	NC_016751	TAA	2	6	17163	17168	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_016751	T	7	7	17177	17183	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_016751	T	6	6	17193	17198	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_016751	TAA	2	6	17213	17218	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_016751	T	8	8	17222	17229	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_016751	AGG	2	6	17264	17269	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
58	NC_016751	AAT	2	6	18647	18652	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_016751	AT	3	6	18666	18671	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_016751	ATC	2	6	19260	19265	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_016751	ATTC	2	8	19287	19294	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
62	NC_016751	AAT	3	9	19298	19306	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_016751	A	7	7	19307	19313	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_016751	TTTCT	2	10	19314	19323	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
65	NC_016751	ATT	2	6	19326	19331	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_016751	T	7	7	19344	19350	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_016751	AT	3	6	19361	19366	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_016751	ATA	2	6	19395	19400	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_016751	AGG	2	6	19416	19421	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
70	NC_016751	T	6	6	21161	21166	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_016751	AATAT	2	10	23839	23848	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_016751	TAT	2	6	24665	24670	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_016751	TATAT	2	10	24674	24683	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_016751	AAT	2	6	27215	27220	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_016751	AAAAT	2	10	27227	27236	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_016751	A	7	7	27267	27273	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_016751	GAT	2	6	27317	27322	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
78	NC_016751	ATTT	2	8	27333	27340	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_016751	TCC	2	6	28696	28701	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
80	NC_016751	C	6	6	29315	29320	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
81	NC_016751	A	7	7	30966	30972	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_016751	A	7	7	30974	30980	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_016751	TGG	2	6	31003	31008	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
84	NC_016751	GC	3	6	31052	31057	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
85	NC_016751	ATT	2	6	31088	31093	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_016751	ATATA	2	10	31094	31103	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_016751	T	7	7	32085	32091	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_016751	AT	3	6	32118	32123	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_016751	TA	3	6	34161	34166	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_016751	CAAA	2	8	34203	34210	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
91	NC_016751	TAA	4	12	34244	34255	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_016751	A	6	6	34262	34267	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_016751	AAT	2	6	39577	39582	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_016751	AAGG	2	8	39586	39593	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
95	NC_016751	ATATA	2	10	40247	40256	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_016751	T	6	6	41375	41380	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_016751	AT	3	6	41387	41392	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_016751	TAT	2	6	41397	41402	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_016751	AT	3	6	41422	41427	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_016751	CAA	2	6	41437	41442	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_016751	A	6	6	41441	41446	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_016751	TAAT	2	8	41452	41459	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_016751	AGG	2	6	41484	41489	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
104	NC_016751	GGAAT	2	10	43584	43593	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
105	NC_016751	AT	3	6	49388	49393	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_016751	ATTA	2	8	49404	49411	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_016751	A	6	6	49436	49441	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_016751	A	6	6	49443	49448	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_016751	A	6	6	49453	49458	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_016751	GAAAA	2	10	49461	49470	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
111	NC_016751	TA	3	6	49513	49518	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_016751	A	6	6	49537	49542	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_016751	A	7	7	49557	49563	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_016751	A	8	8	49570	49577	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_016751	AT	3	6	49582	49587	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_016751	A	8	8	49606	49613	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_016751	TGG	2	6	49636	49641	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
118	NC_016751	ACC	2	6	49658	49663	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
119	NC_016751	ATT	2	6	49748	49753	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_016751	T	8	8	49765	49772	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_016751	TA	3	6	50032	50037	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_016751	A	6	6	50037	50042	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_016751	TGT	2	6	50046	50051	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
124	NC_016751	A	8	8	50057	50064	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_016751	AAT	2	6	50073	50078	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_016751	ATTA	2	8	50095	50102	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_016751	AGG	2	6	50103	50108	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
128	NC_016751	TAT	2	6	50645	50650	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_016751	TAATG	2	10	52627	52636	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
130	NC_016751	T	6	6	52643	52648	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_016751	AAT	2	6	52649	52654	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_016751	GGGT	2	8	53983	53990	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
133	NC_016751	T	6	6	54009	54014	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_016751	A	6	6	54034	54039	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_016751	TAT	2	6	54050	54055	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_016751	ATG	2	6	54081	54086	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
137	NC_016751	AGG	2	6	54114	54119	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
138	NC_016751	T	8	8	54720	54727	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_016751	AAT	2	6	54738	54743	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_016751	ATT	2	6	54772	54777	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_016751	ATT	2	6	54789	54794	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_016751	A	6	6	54802	54807	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_016751	GTA	2	6	54818	54823	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
144	NC_016751	CAAT	2	8	54824	54831	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
145	NC_016751	T	6	6	54840	54845	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_016751	ATTAT	2	10	54846	54855	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_016751	AGT	2	6	54856	54861	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
148	NC_016751	ATA	3	9	55814	55822	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_016751	TAAT	2	8	55834	55841	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NC_016751	TCA	2	6	56504	56509	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
151	NC_016751	TTA	2	6	56545	56550	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
152	NC_016751	GTT	2	6	56556	56561	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
153	NC_016751	TAT	2	6	56566	56571	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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441	NC_016751	A	6	6	211754	211759	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
442	NC_016751	GAT	2	6	211789	211794	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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444	NC_016751	ATT	2	6	211816	211821	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
445	NC_016751	TTAA	2	8	211831	211838	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
446	NC_016751	ATTA	2	8	211921	211928	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
447	NC_016751	ATT	2	6	211945	211950	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
448	NC_016751	AATA	2	8	211961	211968	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
449	NC_016751	TAA	2	6	211982	211987	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
450	NC_016751	AAT	2	6	212063	212068	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
451	NC_016751	T	7	7	212068	212074	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
452	NC_016751	AAT	2	6	212075	212080	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
453	NC_016751	T	6	6	212088	212093	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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456	NC_016751	ATC	2	6	212231	212236	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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464	NC_016751	CAG	2	6	212554	212559	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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466	NC_016751	AAC	2	6	212600	212605	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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472	NC_016751	AAC	2	6	212888	212893	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
473	NC_016751	TCT	2	6	212898	212903	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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475	NC_016751	TTA	2	6	212977	212982	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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478	NC_016751	ATA	2	6	213097	213102	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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482	NC_016751	ATT	2	6	213326	213331	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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